过明确后，最新东银河公司的部门划分如下——
贸易部门，探索部门，研究部门，支撑部门，作战部门。
除此以外，还有游离在部门之外的三大组织，独立运作，基本上不受东银河公司制约——
董事局，家园公司，科学神教。
有了新的部门名单后，由于新部门需要血液流入，而东银河公司员工总数还是没有变，因此得靠编制来进行划分。
支撑部门的编制倒是没有疑议，还是38人，只不过他们终于有了自己的正式身份。
作战部门的编制争议较大，显然是临时作战小组成立时，员工们踊跃的表现引发部门负责人们的担忧，生怕一旦作战部门过度发展，将会一跃成为公司内部最强大的部门。另外，作战部门的职能又是跟他们有些关联，例如负责贸易的船队上是否要有作战部门的员工，如果有，算作是谁的人？贸易部门？这岂不是说贸易部门下面又有武装人员？作战部门？作战部门远隔几十公里指挥前方的武装人员，明显不是种高效的办法。
幸好，讨论之初不少员工提出明确当前作战部门的职责，以保证月球安全为基础，再是允许组建一支小型机动力量，活跃在太阳系，足以满足他们的99%需求。