仆寺李师密，兵部中军周士礼，副、参、都、守周名臣、郑国化、王培元等先后降清，“俱分发内地善行安插矣”。
舟山的失守，大批文官武将的殉国以及降清，这还不是最要紧的，由于横水洋之战的侥幸和舟山城守部队仅仅只有三个营的兵力，明军的兵员损失其实并不多，军事实力犹存。奈何根据地被攻陷，留在那里的家属大多殉难，却直接导致了士气低落而无力再战。
舟山已失，失去了陆上的支点，他们迫不得已之下只得向南前往舟山的三盘岛再行休整。这里曾是平夷侯周鹤芝和闽安侯周瑞的防区，他们与温州、台州以及处州的多股抗清义军皆有联络，曾对浙江南部实现过不小的威胁。
随着周家兄弟内讧，周瑞远走福建投奔郑成功，周鹤芝很快也选择了北上舟山。否则的话，若兄弟齐心，清军南线受压，势必难以对舟山形成合围之势，舟山明军也不用分兵南下截击马进宝，舟山城守的部队能够更多一些，或许也还能多撑上个几日，明军舰队也存在着在这几日之间突破清军水师拦截的可能。那么，舟山之战势必将会成为浙江明军精锐全军覆没的一战，历史也将会大为不同。
但是，这样的如果是不可能存在的，就像是鲁监国朝内部，就算没有周家