当天傍晚，731部队的损失情况初步汇报送达了梅津美治郎的手中。这份由关东军情报本部本部长柳田元三和哈尔滨警备司令部司令藤井光和共同署名的汇报令梅津的脑袋又痛起来了。
报告称：731范围内的建筑物遭到严重损毁，其主要建筑物被破坏程度最为严重，已基本报废。建筑物内安放的各种设备、机器、仪器及生物战剂成品全部被烧毁。
能辨别的日军军医及士兵的尸体356具，结合外出归来的人员人数及731原本人数推算，还有多达500人失踪，据信绝大部分已经玉碎，他们的遗体随着大火被燃烧殆尽。
阵亡的佐官8名，尉官98名，失踪的将官4名，佐官32名、尉官322人。
根据调查，事发当时，731部队的4名将官都在现场没有离开，据此可推算，这四名将军业已玉碎。
报告最后分析到敌军这次行动颇多疑点，他们是如何进入平房区的，从哪里来的？为何对731内部机构如此熟悉？他们怎么知道643部队将要抵达哈尔滨从而冒充643部队？对731破坏之后又消失到哪里去了？这支敌军能够做到不浪费一点人力精准打击，不浪费一点时间环环相扣，无疑是掌握了731内部的大量绝