《星际火种2：叛乱》的体量完全是按照常规的3a大作来规划的，它的故事跨度很大，从建造行星发动机一直到行星发动机全面启动，玩家得以在游戏中看到整个行星地表的不同变化。
最早星球表面是一片赤红色的土壤，虫族在地底活动，可能随时会从松软的沙地下钻出来，让玩家措手不及，抬头就能看到正在修建中的如山脉般庞大的行星发动机；
但在游戏的后期，行星发动机启动之后，星球离恒星越来越远，地表的温度急剧下降，此时再回到地表，就会看到一片冰天雪地的场景，二氧化碳化成的干冰覆盖了整个地面，只有行星发动机周围的温度较高，行星发动机喷射出的淡蓝色粒子尾焰照亮了天空，整个世界发生了天翻地覆的变化。
之所以可以完成如此巨大的时间跨度，是因为玩家扮演的角色经历了冬眠，肩负着特殊的任务在未来醒来，他必须阻止飞船派，让星际火种计划的第三阶段得以顺利进行。
同时，作为一款3a大作，《星际火种2：叛乱》也拥有许多个大型场景，这些大型场景的风格完全不同，玩法也有区别。有的场景是线性关卡，有些场景则加入了一些开放世界元素。
这些场景大致包括：常规地表（行星