和炮台毁坏，而转移至当时的台湾岛，明朝亦不干涉荷兰对台湾的占领。荷兰人先在北汕尾(今台南四草)建立简易的商馆，正式在台湾落脚。
随后，于一六二五年，荷兰人在一鲲鯓(今台南安平)筑热兰遮城，作为屯兵与侵略的主要据点。这便是台湾为外来政权占领的开始。
从此之后，直到现在，荷兰人用枪炮之威和残酷杀戮，逐渐征服了整个台南地区，随后荷兰人不断涌入这个地区，长期固定居民多达过万，海6军兵共有数千人之多。
而自荷兰人占据台南后，他们将那些听命于自已的土著，称为熟番，而那些尚未屈服于其威压的的台湾土著，则称为生番。
在前几年，见荷兰人在南台湾干得风生水起，西班牙也蠢蠢欲动，立即出兵占领了北台湾。自此以后，台湾的西部平原地带，才形成了北部为西班牙人占领，中部为郑芝龙部占领，南部为荷兰人占领的三家分据态势。
当然，荷兰的野心不仅仅满足于只在台湾这片蛮荒之岛，在台湾稳定立足后，野心渐渐膨胀，又有复侵澎湖及福建的打算，终于导致了崇祯六年的料罗湾大海战。
这一年农历六月初一（公历1633年7月6日）起至九月二十（公历1o月22日