逮捕了这些教徒之后，便要为他们举行“踏绘”的仪式。所谓“踏绘”，是指将刻有耶稣受难像的木牌扔在地上，让怀疑为教徒者用脚去踩，肯乖乖从命的定非天主教徒，或者虽是教徒却有心悔改，否则就将被处以火刑。这种方法并非松仓胜家所创，而是幕府搞出来并到处推广的无聊花样。
但是，这群教徒看来是有着坚定信仰的。拒绝举行踏绘。于是，便被处以火刑。
这就点燃了早就积压了许久的矛盾。同为外样大名，松仓家不像岛津家，属于最早同南中军展开贸易活动，有着天然优势的外样大名。但是，既不如人家有优势，又要在一年一度的参觐交代中不能在西南诸藩中落了下风。于是便只能在农民身上打主意。征收赋税标准是九州地区最高的，农民到南中打工寄回来的辛苦钱也要被公家收取一层赋税，并且还要七折八扣的计算汇率，如此一来，这就可想而知矛盾积累的多么严重了。
十月二十日，岛原有马村纷起一揆，杀死了松仓氏的代官林兵右卫门，并且攻破藩武器库，团团包围住了松仓氏的本城——岛原城。
二十七日，天草群岛也爆发一揆，与岛原一揆南北呼应。天草群岛乃是肥前国唐津的谱代大名大久保氏的飞地，唐津藩的代官三宅重利