他事劾之，下吏，削籍归。
十五年诏举边才，用荐起故官，监通州军。勤王兵集都下，剽劫公行，割妇人首报功。师孔大怒。以其卒抵死。明年，举天下贤能方面官，郑三俊荐师孔。六月，擢右佥都御史，代蔡官治巡抚陕西，调兵食。
冯师孔其实有些无意仕途，只想在家闲暇。 却不料被郑三俊举荐到陕西来当这个巡抚，给孙传庭管理后勤，筹措粮饷。
李家父子在山东推行所谓新政，可是弄得天怒人怨。弹劾的奏章、扣阙的状纸几乎能够从北京排队排到南京。可是，皇帝也只能当做没看到，一者。当时在打仗，惹不起这些带兵官员。二来，李家与大明体制却是若即若离的，同各地土司相比较而言，对于大明朝廷的依赖程度，比起石柱土司秦良玉还要低得多。所以，即使是圣人后裔也是对李家父子在山东的作为怨恨满腔。皇帝崇祯却也是置若罔闻。御史言官们逼得急了，皇帝便是冷冰冰的丢下一句话来。
“朕可以下旨，索拿李家父子进京问罪，甚至可以下旨将其抄家。尔等那个敢去传旨？”
“李爱卿父子在山东，剿灭流贼土寇，驱逐建奴教匪，更是鼓励农桑，抚慰流亡。便是地方钱粮赋税上催的紧了些，要的急了些、多了些，也是