课的办法，天启皇帝讲课时的时侯“声情并茂”、“绘色绘影”，很受天启皇帝的喜爱，天启皇帝每次听完孙承宗的课，也非常高兴；袁可立、徐光启等人也给天启皇帝讲过课，但这么多老师当中，天启皇帝最喜欢点孙承宗这个“大胡子老师”的课，孙承宗因此被升为少詹事。
天启元年，沈阳、辽阳失陷于建虏之手，袁应泰也自杀而亡，当时京城人心浮动，朝臣们都认为孙承宗懂军事，应该让他出马；御史方震孺更上书天启皇帝，请求罢免当时任兵部尚书的崔景荣，用孙承宗来代替他；天启皇帝喜欢听孙承宗讲经筵课，不舍得放他，方震孺几次上书请求，天启皇帝不得已之下，让孙承宗担任兵部左待郎。
天启二年，广宁也失陷，天启皇帝这次再也坐不往了，他决定让张鹤鸣退休，启用孙承宗来应对建虏，于是天启皇帝拜孙承宗为兵部尚书兼东阁大学士，又过了数日，天启皇帝更任命孙承宗为内阁成员。孙承宗上疏曰：“迩年兵多不练，饷多不核。以将用兵，而以文官招练；以将临阵，而以文官指发；以武略备边，而日增置文官于幕；以边任经、抚，而日问战守于朝；此极弊也。今天下当重将权，择一沉雄有气略者，授之节钺，得自辟置偏裨以下，勿使文吏用小见沾沾陵其上。边疆小