（宣子）未出山而复。太史书曰：“赵盾弑其君”，以示于朝。宣子曰：“不然。”对曰：“子为正卿，亡不越竟，反不讨贼，非子而谁？”，赵盾遂无言已对，孔子评曰：“董狐古之良史也，书法不隐。”后人尝用董狐直笔来形容史官刚直，坚持原则。
黄尊素又拿一些当时公认的奸邪之人来举例：“进廷杖之说者，必曰祖制，不知二正之世，王振、刘瑾为之；世祖、神 宗之朝，张璁、严嵩为之。奸人欲有所逞，惮忠臣义士掣其肘，必借廷杖以快其私，使人主蒙拒谏之名，己受乘权之实，而仁贤且有抱蔓之形。于是乎为所欲为，莫有顾忌，而祸即移之国家。万燝今已矣，辱士杀士，渐不可开。乞复故官，破格赐恤，俾遗孤得扶榇还乡，万燝死且不朽。”疏入，益忤魏忠贤意。
八月，河南进玉玺。魏忠贤欲侈其事，命由大明门进，行受玺礼，百僚表贺。黄尊素上言：“昔宋哲宗得玺，蔡确等竞言祥瑞，改年元符，宋祚卒不竞；本朝弘治时，陕西献玉玺，止令取进，给赏五金。此祖宗故事，宜从。”事获中止。天启五年春，遣视陕西茶马。甫出都，逆党曹钦程劾其专击善类，助高攀龙、魏大中虐焰，遂削籍。
黄尊素謇谔敢言，尤有深识远虑。初入台，邹元标实援之，