近的军队分批运往江北进行防御。如果江南产生内乱，江北的兵力也可以运往江南地区平叛。虽然船只是少了点，但却是这个时代沟通南北的唯一渠道。
只是南明水师提督刚刚上任，好不容易从芜湖、常州一带招募来二十艘可以用于水战的战船和两艘艘江浙水师在和郑芝龙的战斗中幸存的大福船。这已经是南明政权在南京附近集结的所有水师了。其余的水师控制在两湖、江北、两广的明军水师游击手中，信息堵塞的他们还不知道南京城受到了九州军两个舰队的威胁。
福州府城东南河口是官营造船厂的主要聚集地，势力局限于南京城的南明政权一时半会来不及让福州府生产一批战船出来。何况福建巡抚沈犹龙还没有明确支持南明政权，福王、现在的弘光帝的命令，沈犹龙服不服从都还是一回事。
“提督大人，是九州军的战船，他们包围了我们！”南明水师发现北洋舰队和直隶舰队的时候，停留在镇江船坞附近的南明水师船只已经被两支舰队给堵在了码头。
水师提督此时在岸边的营地里休息，他万万没有想到九州军会千里突袭镇江，吓得一个激灵：“他们来了多少战船？”
“上百只啊，而且很多战船比我们最大的福船还要大上几倍！