士集团大部分都失去了继续战斗的勇气，无法阻止有效的抵抗。
“留一支小队控制福山城，其他人随我押送俘虏返回江户城。”张元在北海道追击消灭了叛乱武士集团最顽固的残余分子之后，便令众人上船返回本州岛。
北海道的荒凉注定了将来这里还远远不会成为商业繁荣的地方，也许在这里以后会成为比较原始的旅游地点。附近还有世界四大渔场之一的北海道渔场。
凯旋而归的讨伐军乘坐直隶舰队的船只返回江户城，经历过东北大战的新官府军威震本州岛，特别是新官府军一路猛打猛追，完全没有适可而止的意思 ，更让欺软怕硬的武士们畏惧。原本还在观望的大名和慎重的武士见反抗者失败被杀，不得已只能够听从新官府的命令，将武士刀、火绳枪、仿造枪上交给官府。
如果违反“废刀令”的人，则会被视同为违法，需要被判刑。新官府还组织检查队挨家挨户查收能够反抗的兵器，武士刀、长矛、火绳枪、军用弓箭都被视为兵器。抵抗激烈者甚至会被判处死刑。
“废刀令”不只是波及到了武士阶级，对于拥有冷兵器的平民来说也造成了影响。一些曾经参与过战争的平民拥有长矛、长弓等兵器，一律被官府没收。