，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。
卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。最终机关城破，被墨家巨子启动自毁装置，几百年建设而成的奇迹之城毁于一旦。
后荆天明和墨家等人来到了桑海城，联合儒家，经历一系列的围杀与逃遁，伴随着帝国夺嫡阴谋，上演一幕幕大剧。
与此同时，蜃楼也建造完成，云中君主持，准备奉始皇之命，东渡寻访仙山。
这就是秦时明月的主要背景。
其中涉及纵横家、儒家、墨家、道家、阴阳家、农家、名家、法家、兵家、医家等等，群星璀璨，思想碰撞，这是一个前所未有的灿烂时代，英雄辈出；也是一个动荡不安的时期，百姓困苦。
故事就从一个叫做盖聂的人开始。
他被称为剑圣、天下第一剑、秦国第一剑客、帝国最强剑士。
盖聂气质从容淡定，处事冷静。师出鬼谷，剑术出神入化，被称为秦国最强的剑客，在江湖上享有“剑圣“的名号，但是却意外地从秦国叛逃，带着故人荆轲之子荆天明，亡命天涯。
残月谷，被帝国三百骑兵追上，一人一剑，屠尽铁骑，却也身受重伤。