保留了首都所有的待遇。
在南京有与北京完全对应的中央机构，六部、都察院、翰林院一个都不少，而且编制基本满员。
不过，南京官员的品级、官位，虽与北京相同，但其实没有实权，没有事情可干，都是一些政治斗争失败，或者能力不足，被淘汰下来的人，来南京任职。
其实南京就是从官场斗争中淘汰的人，或是被打入冷宫的臣子的一个流放之地。
现在北京覆灭，南京的大臣们便翻身做了主人，可算轮到我们牛逼了，他们自然要维护自己手中的权利。
无论是东林还是马阮，都想趁着北都沦陷，在京官员被一锅端的机会，让自己人控制中央到地方。
正是在这种背景下，南明朝廷将南下的官员拒之门外，便不奇怪。
不久之后，东林党人为了对付马阮，又提出不准起用曾被定为阉党的官员，将一大批在野官绅，挡在南京朝廷之外，好方便他们掌权。
而在南京朝廷大兴顺案、逆案，马阮和东林相互排挤之时，占据北京的东虏，却借着洪承畴等人的关系，招降了冯铨等一大批被南明拒绝的官绅，使得满清得到了不少官绅的支持，从而在北方站稳了脚跟。
历史上满清