或南司，十二卫属南衙，由宰相负责，所以又称为南衙禁军。
而元从、羽林等禁军起初没有专门机构，多由皇帝通过宦官或武官亲领，就比如说深得李世民信任的阿难大总管，就身兼禁军将军的职责。
宦官居禁苑内，与南衙相对，故称北衙。
禁军常屯驻北门，所以称为北衙禁军，主要负责皇宫宿卫，显然非皇帝最信任的军队不能胜任。
只是历史上的大唐后来出现宦官控制皇帝废立的可悲局面，根子怕是也在这呢，当然也和后来的几位皇帝不够强，没能力挽狂澜有很大关系。
皇帝通过兵部掌握了十二卫与六率所统府兵的发兵权，从而加强了对军队的控制，尤其是李世民这样的强势皇帝在台的话，掌控力自然是无与伦比的鼎盛。
这对维护封建中央集权国家的安全与稳定，有着至关重要的作用。
因此，南北衙的建立，也标志着封建军事管理制度的成熟与完善。
在大唐上下对军队进行改制期间，也发生了一些小插曲，不过倒也不是在大唐境内，对大唐的稳定局势并没有太大的影响。
可以说整个过度是很平稳的，可见李世民不是盲目自信，而是他的手腕确实足够强悍，