第七使徒入侵外加羽戊良乱入过后，暂时性进入平稳期。
三名驾驶员受到了不同程度的伤害，不过情况都还不错，经过nerv高科技的治疗后，差不多用了2-3天时间便恢复过来，毕竟他们受到的仅为精神上的创伤。
至于三台eva的修复工作就稍微长一点，它们遭受了相当严重的损伤，尤其是初号机和零号机。
两台eva被羽戊良和第七使徒连番蹂躏摩擦，修复起来需要一定的时间。
期间发生了很多事，比如加持良治给碇源堂带回来一个“尼布甲尼撒之钥”……
（这玩意暂时不清楚有什么用，应该在剧场版第四部中提提到，作者君推测有可能是碇源堂实现补完计划的一个重要部件，让自己成为完整（完美）生物的关键所在，当然这只是猜测。
当然作者君拿它可是有用的哦~）
还有恢复如初的碇真嗣他们，为了联络感情，一群人前往【国际环境机关法人——r国海洋生态系保存研究机构】，观看在第二次冲击之前海洋中生活，如今本应灭绝的海洋生物。
也正因为这次社会课的参观活动，让三名驾驶员之间的关系增进了，至少没有一开始那么僵硬。