女神再次眷顾了他。在由奥斯曼土耳其人操纵的火绳点火滑膛枪和火炮的支援下，巴布尔竟奇迹般地以12000人的小部队打败了印度的10万大军。他乘胜占领德里，作为他的新首都，莫卧儿王朝就此建立。
虽然巴布尔在攻占德里四年后便去世了。但他的儿孙显然比他更有做君王的天赋。特别是在他的孙子阿克巴（1556-1605年在位）统治期间，印度经历了一系列重要的改革，莫卧儿帝国就此臻于鼎盛，其疆域从喀布尔和克什米尔扩大到了德干高原，最终成为与奥斯曼帝国并肩的伊斯兰强国。不过与穆斯林的波斯帝国和奥斯曼帝国大不相同，莫卧儿帝国的上层建筑虽是穆斯林，其基础却是印度教的。故而莫卧儿帝国疆土虽大，却没有像中国那般实行中央集权的行省制。而是采取了较为松散的军事采邑制和封建土地的世袭占有制。
为此，莫卧儿人将征服的印度国土统称为“哈利萨”，意为国家直属地或国库地。除了直属国王的封建领地外，帝国的其他大部分土地都按战功分封给贵族作为军事采邑，叫做“扎吉尔”，其占有人称为“扎吉达尔”，以军事服役为条件。另外在印度，还有不少不受帝国直接统治，但却臣属帝国的土著部落酋长和印度教王公，以及帝国直接统治地区中