此外，明朝鉴于当时西藏佛教各教派势力争雄，各霸一方的现实，一改元朝只推崇萨迦派一派的做法，对西藏各教派采取多封众建，凡有实力的教派首领，都赐加封号，使其为朝廷效忠。明朝先后赐封了噶玛噶举派哈立麻为“大宝法王”，萨迦派昆泽思巴为“大乘法王”，对后来居上的格鲁派（黄教）释迦也失先封为国师，后加封“大慈法王”。这三大法王中以“大宝法王”地位最高，噶玛噶举派最受重视。法王奉朝廷使命，行使地方职权。法王之下还封有“赞善王”、“护教王”、“阐教王”、大国师、国师等等。均各有管辖领地。明朝对赐封过的上层僧俗领袖人物都确立朝贡关系，特发凭证准予进京朝贡。每逢贡期节庆，各地僧俗首领都遣使或亲自来京朝贺，呈贡方物谢恩，朝廷对来使都给予大量回赐，其数量和质量均远远超过朝贡品。致使朝贡使团不绝于途，由此也密切了西藏上层与中原中央的往来关系。
自中原战事平定，中华朝建立之后，如何接管西藏便成了弘武女皇所关心的重中之重。不过由于明朝后期内乱外患不断无暇顾及西藏。因此，朝中大臣对西藏的现实情况也知之甚少。他们中的不少人甚至还以为西藏至今仍在萨迦派（红教）的控制之下。相比之下，反倒是自二十一世纪的孙露对西