收留了与白山部有不共戴天之仇的黑山部。而对内，同样是出于宗教的原因，玉素甫和卓采取了极为严酷的宗教统治。他排斥异己，滥杀无辜，血腥镇压黑山派，强制推行白山派，焚毁一切非白山派的典籍和文献。对于玉素甫和卓来说，这些极端手段是绝对必要的，甚至这其中还代表着对神的敬意。因为在这些“和卓”眼中没有比宗教更为重要的事情。排除教派中的异端邪说，净化人们的心灵，是他们义不容辞的使命。因此无论是白山派掌权，还是黑山派掌权，都无一例外的都会操起屠刀残杀异己。而在些过程当中也免不了会为当权者带来一笔笔数目巨大的财富。
当然在卓特巴巴图尔看来这种为了宗教教义而自相残杀，继而导致政局混乱的做法无疑是愚蠢而又无意义的。信奉喇嘛教的他实在是难以理解白山回与黑山回的那种宗教狂热。不过难以理解归难以理解，作为一个统治者卓特巴巴图尔还是极其乐意看着玉素甫和卓他们如此的自相残杀。因为若非如此他又怎会有机会在这么短的时间里控制天山南北呢。
想到这些卓特巴巴图尔的笑意不由地变得更浓了。却见他一改先前的冷淡，宽声向玉素甫和卓点头道：“和卓真是守信之人。和卓放心我准葛尔汗国也一定会遵照事先的约定保护白山部