护下，多年马放南山，刀枪入库，根本不思 修行，只知道享乐，在与拜火教和隆武府的对决中，渐渐不支，落于下风。
最后，传出死讯多年的玄机门创派祖师张道济，突然出现，挫败了拜火教和隆武府一众高手，黄巢虽有修习崂山术，但纯属一瓶不满半瓶咣当的水平，与张道济交锋时候被诱导做出了错误决策，导致黄巢掘陵时虽然动用多达40万起义军在梁山西侧挖山掘墓，差不多挖了半座梁山，但最后仅挖出了一条深40米的“黄巢沟”，居然连乾陵的边都被挖着，使李唐王朝的乾陵躲过了劫难。
所以，在黄巢入主长安后，大肆搜捕玄机门道众，非要将玄机门灭派不可，也因此导致了玄机门法宝逐一失落，淹没在历史中再无踪迹。
后来起义失败，关于黄巢的踪迹说法不一，一说是黄巢在兵败狼虎谷时候自杀，让外甥林言带他的首级去献给唐朝，一说是被外甥林言在狼虎谷所杀，同时被杀的还有黄巢二弟黄邺等七人。一说是黄巢在今河南中牟西，遭沙陀骑兵突袭，牺牲万余人，手下大将尚让忽然反叛，杀了黄巢。这些说法都是黄巢身边人为了邀功，自编其说而已。
实际上，黄巢兵败遁免，后祝发为浮屠，其就是五代时的一个高僧，法号翠微禅师