直下，葡萄牙人在合并后的20年内一共进行了50次焚烧仪式，数千名犹太人或者被烧死，或者被迫悔罪苦修，改宗天主教。剩下的，要么流亡国外，要么改信后去了巴西（巴西一度有超过两万改信的犹太人“新基督徒”），整个伊利比亚半岛的犹太社区就此消失殆尽——值得一提的是，伊比利亚半岛流亡的犹太人大部分去了绿教徒国家，并成功定居了下来。
意大利的犹太人一开始倒颇受重用。除了西班牙统治下的米兰、那不勒斯、西西里岛、帕尔马等地，其余邦国的犹太人比较自由。尤其是在威尼斯，很多工厂都是犹太人开办的，很多港口城市的繁荣也是因为犹太人的存在，威尼斯最大的一个犹太人社区居住着超过六千人，整个社区也都是犹太建筑师设计的。
但意大利人犹太人的命运很显然不是一帆风顺的，当地贵族的贪婪或者宗教倾向或多或少让他们大受损失。比如曼图亚公爵就经常向犹太银行家“借贷”（勒索）。在罗马出了一个反对犹太人的教皇后，他们一度被限令在三天内离开，原因是教皇认为他们的高利贷极大伤害了罗马市民，最后犹太人在贡献了大量珠宝和金钱之后才得以幸免。
西欧诸国中仅有英、法、荷三国的犹太人过得较为舒心。法国的黎塞