不愿降清，杨威已经有些无法控制局面。在派人上岸沟通了一番后，登州城内七千明军只有寥寥两千余人愿意跟随秦尚行等人前往烟台，其余人在城内士绅的鼓动下决定降清。眼看大势已去，也不愿投靠东岸人的杨威决定削发入山，他的一些铁杆手下也带着部众出城四散，城内剩余的三千多人（几乎全为不堪战的）打开了城门，跪迎清军入城。
面对登州这种名城，清军自然不可能不派兵留守，他们散掉了投诚的三千明军，然后在城内留驻了后续赶来的两千步卒。后来行至福山县时，虽然此地城墙地基均已被东岸人毁去，但由于地处粮道转运节点，清军依旧留了两千人驻守；后来又派了部分人手出去砍柴，再算上路途中押运粮草的、留守青州莱州的，几番分薄后能用于攻打烟台的人马其实只有五万人左右，其中战兵约两万余人（含七千满洲战兵）。目前已经到的三万多人（含一万夫子）里超过一半是战兵，基本上是主力尽至，后续的四万多人（含一万夫子）预计将在接下来两天内陆续汇集。
清军到来后，当天晚上就组织包衣、夫子在烟台堡南方连夜挖掘炮位，架设大炮，显示出了他们急迫的心情。想想也是，马上就是青黄不接的季节了，五六万清军顿兵烟台城下，这消耗可不是一般的