丘陵地带，河流在深切的“v”形起谷中穿行。该地区属于巴拉那沉积区（包括阿根廷、乌拉圭和巴拉圭的一部分，并包括了巴西100万平方公里的土地）。河道险滩、瀑布密布，经常出现大拐弯（有寸弯度高达270°）。中、下游河道地势较低，海拔250米左右，水流平缓。
上、中游地区为巴西最南端，属亚热带气候，夏季炎热，冬季寒冷，年平均气温为16～19；下游属温带气候，最凉月（7月）平均气温约l0，最暖月（1月）平均气温为23.3。多年平均流量4600立方米/秒，最大洪峰流量37000立方米/秒，年均径流总量1451亿立方米.径流的季节性不强，5—10月出现大洪水的可能性较大。可道中的泥沙大部分为悬沙，且由于流域内河道两岸的表土呈粘性，悬沙浓度不很大，因此，河床淤积是很小的.年均输沙量约为1700万吨。
乌拉圭河的洪水特点是，上游坡陡，洪水最大，洪水位变化快，下游坡缓，洪泛区长时间被洪水浸泡。据统计，在1983～1990年的8次大洪水中，平均受灾城市数目达22个，平均受灾人数达8969人，其中1983年大洪水为最大，受灾城市达73个，受灾人数高达27650人。
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