8个城镇、45个行政农庄。楚科奇民族自治区的中心为阿纳德尔市（英文：anadyr；俄文：Аhaдыpь）。1998年1月1日，该市人口有1.32万人，建市时间为1965年，由马加丹至阿纳德尔距离为1525公里。自治区内附属第二大城市为佩韦克市（英文：pevek；俄文：Пeвek），于1967年建立。现任区长：罗曼·阿布拉莫维奇（俄文：pahАpkaдьeвnчА6paвnч；英文：ranarkadievihabravih）
楚科奇自治区被分成8个区（panh），分别为：
阿纳德尔区(英文：anadyrskyrayn；俄文：Аhaдыpknnpanh)
白令戈夫斯基区(英文：beringvskyrayn；俄文：Бepnhгвknnpanh)
比利比诺区(英文：bilibinskyrayn；俄文：Бnлn6nhknnpanh)
乔尼区(英文：haunskyrayn；俄文：Чayhknnpanh)
楚科奇区(英文：huktskyrayn；俄文：Чyktknnpanh)
伊乌利京区（英文：iult