改革了传统的蒙古作战方式，设立了规模庞大的步兵编制，平日里骑马机动，作战时下马以火器进行战斗，为此他还在境内设立了兵工厂，专门生产各类火器装备，就像成吉思汗时期蒙古人所做的那样，水平比起如今漠北、漠南蒙古诸部那不成器的水平不知道要强上多少。
此外，噶尔丹也极大强化了蒙古骑兵的战斗力。他将一部分人脱产，作为自己的常备军，终日训练、厮杀，是一支纵横草原的精锐力量。在征服哈萨克人、攻灭叶尔羌汗国、扫平中亚游牧民武装的战斗中，这支勇猛的骑兵部队都发挥了极大的作用，可谓是威名赫赫。
如此步、骑兵结合，噶尔丹在军事上获得成功也就不那么令人感到奇怪了。说起来，颇有些类似南俄平原上的哥萨克和鞑靼人了，也难怪他们可以在中亚一带死死压制住俄国人的殖民势力，同时还有余裕击破各路反对者。相信若不是执着于自己统一蒙古世界的宏图美梦的话，准噶尔汗国在西域一带会存在很长一段时间，甚至俄国人的殖民脚步都不得不被遏制住，哈萨克人、乌兹别克人更不可能有出头的日子。
“魏长官，说道联络漠西蒙古的人，如果我们不成的话，您不妨和那些喇嘛们多交流交流。他们的能量其实还是很大的，关系网遍布