战，朝中又有大学士周延儒、兵部主事张国臣等人主张招抚。这么一拖来拖去，孔有德又从辽东皮岛招来了原来的部下三千余人加入叛乱。徐从治等人在莱州苦苦守了几个月，等来的援兵却止步于莱州40里之外，总兵邓圮、王洪等人就等着朝廷的招抚措施能够成功。
然而朝廷的招抚政策并没有起到什么卵用，倒是执行这个命令去孔有德军中谈判的的副都御史谢琏、莱州知府朱万年也一并被擒。到明廷意识到谈判破裂，招抚无用，必须使用军事手段解决问题的时候，山东巡抚和莱州知府都已经死在了战场上。直到吴三桂的老爹吴襄带兵打过去，才总算解了莱州之围。而这时候距离孔有德起事已经过去了近一年的时间。
当时朝廷从周边各省调兵前去平乱，光是总兵这种高级军官就有四五个，兵力更是叛军的数倍之多。然而平乱之战却打得一塌糊涂，文官武将在这场大乱中死了一堆，山东东部沿海地区都被打成了废墟，无数百姓因此而流离失所，损失可谓十分惨重。在这个过程中，外地进入山东平乱的部队为数不少，但真正起到作用的却并不多。海汉民团的战力固然强悍，但去这么远的地方客场作战，而且很可能得不到友军的协同和地方上的支持，这就很难保证在战场上能够发挥出应有