到了洪武十三年时，朱元璋以“权不专于一司，事不留于壅蔽”为由，为了防止军权的过分集中，就废了大都督府，将大都督府一分为五，改为中、左、右、前、后五军都督府，分别管理京师及各地卫所。
自此之后，由五军都督府管理天下外朝兵马，便为定制。
说来，朱元璋定下的这制度，可谓是极大的保证政治干涉不到军队的，目的和后世的天朝一样，再怎么乱，军队也不能乱。
只是，朱元璋想的再好，也抵不住漏洞，大明功勋军将的世袭制，还有军户的户籍制度，却是让军队不乱也乱，最终原本朱元璋引以为傲的卫所制，久而久之，成为一台腐朽的军事机器，能够勉强守成，进取却难。
当然，这一切对于军队中高高在上的武臣勋贵而言，威胁不大，毕竟，他们世袭罔替，逃过了朱元璋的大清洗，大明后来的皇帝，碍于祖制，还有他们在军队的势力，都对他们倚重有加，不到万不得已，不敢动他们的。
本来，按理来说，就算军队腐朽，但毕竟掌管着大明的军队，武臣勋贵和五军都督府，于现在而言，应该在朝中地位不低，与文官分庭抗礼才对。
只是，随着一场土木堡之变，武臣勋贵集团主要成
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