朝廷改为海运自无不可，但涉及百万军民，此事还需慎重，当廷议之。
崇祯皇帝看了，想了一会之后，便立刻召开廷议。虽然他知道海运的好处，可有关漕运的，还真不是很熟悉。毕竟后世的时候，已经没有漕运，而在原崇祯皇帝的记忆中，也只有以往奏章上片言只语的相关描述而已。
文华殿内，崇祯皇帝先让群臣看了这份奏章之后，他首先表态道：“海运便宜的好处，不止黄总兵奏章所言，朕亦知道。不过朕觉得首辅也是老成持重，因此朕想听听诸卿的看法。如果朕决心要改为漕运，有何影响，有何困难，又如何解决？”
这是定了基调，让这些大臣就在这个框框内商议了。
众臣互相看看，最终还是薛国观先出列奏道：“陛下，臣非危言耸听。概我大明北方粮食，只说京师所需，还有边关军粮，主要征自南直隶和浙江，约占全国漕粮的六成。除漕粮外，还有白粮，由苏州、松江、常州、嘉兴和湖州五府供纳，岁额二十一万四千石，均系当地出产的白熟粳糯米。如此之多的粮食，全都是通过运河运输。”
说到这里，稍微停了停之后，他才接着又道：“为此，朝廷设漕运总督，领卫军十二总共十二万七千六百人，运船一万一千七百只