每卫的将领或者在品级上有较大的差距，但在职事之上，却是一模一样的。
将军之下，设中郎将，左右郎将，录事参军，兵曹参军，仓曹参军，骑曹参军，胄曹参军。军队编制，十人为什，设什长，每什领十丁，什长为陪戎副尉；什上设伙，每伙领五什，伙长为陪戎校尉；伙上设队，每队领三伙，队长称队正，队正为仁勇副尉或仁勇校尉；队上设营，每营设五队，营官为御侮校尉或副尉；营上设旅，每旅设三营，旅帅为宣节校尉或副尉；旅帅之上，则是本卫将军了，每卫设十旅。除开这些战兵之外，每卫还另设包括野战在内的后勤辅助兵种。
如此算下来，每卫兵马的编制基本在两万以上。根据每卫所驻扎的地点，所面临的任务的不同，各卫兵马的编制也不尽相同，不低于两万，不高于三万。
兵马编制人员的核定由兵部负责，但军队将军级别以上的军官由宰相提名，皇帝批准，六品以下军官的任命由兵部提名，却需要通过吏部的审核。
军队的装备每年由兵部提出预算，提交户部审核，然后再将经费拨给兵部，兵部再向将作监下达订单，由将作监自己制作或者向外采购。
军队薪饷的发放，则由户部直接按照核定的人员编制下拨到各卫