帝军机大事，主持军机处全面工作，并主要负责新军和西山军校的筹建。
军机中丞、兵部尚书王在晋的头衔上又多了个蓟辽总督的职务，会议结束之后，王在晋将带着朱由检赐予的尚方宝剑前往辽东上任，总督辽东、蓟州二镇。
袁崇焕、鹿善继、茅元仪不仅要辅佐孙承宗筹建新军和军校，还要负责组建军机处参谋司，培养参谋人才，这也是为日后朱由检组建总参谋部打基础。
范景文、李邦华两位东林党骨干则被分配到四卫营，督四卫营。
所谓四卫营，便是皇帝二十六卫亲军中的精锐，分别为腾骧左卫，腾骧右卫，武骧左卫，武骧右卫。
在二十六卫中，其他卫营都是守卫皇城，俱为步兵；而四卫则是随驾护卫，属于皇帝的亲卫部队，基本皇帝走到哪里，四卫则跟到哪里，且四卫还是最精良的骑兵，这也是四卫归属御马监掌管的原因。
按照卫所编制，一卫兵马应有5600人，但如今卫所制度已经彻底败坏，一个卫所能有一千兵马都算不错了。
而四卫营多年没有征战，战力早已荒废，全部兵马加起来也不过五千而已，御马监的军马，也仅有三千之数，五千兵卒中，能骑高头大马的骑兵不足一千。