史可法先不急于理事，而是往各下属衙门转转，每当他从门口经过，屋子里的人均是神 色一肃，坐的笔直，那表情一丝不苟，甚至隐隐还能听到低呼：“漕抚来了，漕抚来了！”
因漕运总督权力显赫，不但管理漕运，还兼巡抚，故称漕抚。
史可法也没呵斥，只是摇了摇头，毕竟漕运总督自景泰初年设立以来，已有一百多年的历史，经手钱粮无数，尤其是天启年间，朝庭废了漕运总兵，使得总督衙门集军、政、财于一身，各方势力在衙门中盘根错节，非一朝一夕所能清理，换句话说，能在上任的短短一年间，做到这一步已经很不容易了。
漕运总督下属五大块，其一是提督漕运及江北军务。
其二是军门，包括中、左、右和城守营，也是漕运总督的标营。
其三是漕运事务，又分为六大块，包括各省粮道、监仓户部主事、船政工部主事、理刑刑部主事、巡漕御史与漕储参政。
其四是协同押运，包括各总兵、参将、守备与卫所运丁。
其五是抚巡江北四府三州。
整个衙门位于现今的淮安市中心，占地三万平方米，有文官武将两百七十多人，下辖储仓、造船厂、卫漕兵厂等，合计约两万人