使后不久，右丞相陈宜中为迁都事杀殿前指挥使韩震，引起殿前司左翼军兵叛。左翼军统领夏璟便联合蒲寿庚，连续挫败宋军，取得瑞安、温陵、三阳大捷。
建炎三年三百多赵宋宗室子弟随南外宗正司迁至泉州，并在这里繁衍生息，到了宋末宗室成员已达到三千多人，不过蒲寿庚却随便找了个借口将这些人全都杀害殆尽。
显赫的权力与雄厚的海上实力相结合，使蒲氏成为宋元鼎革之际一位举足轻重的人物，因此大宋也没有办法，便任命他为福建、广招抚使，总海舶，这使得他有了更大的权力。
而在后面的历史上，当元兵由浙江入福建。为避元军，南宋陈宜中、少保张世杰率舟师十万，奉宋端宗赵昰及卫王赵昺、杨太妃等，由福州航海至泉州城南郊法石下辇村，欲作都泉州。宋室冀得蒲寿庚之助，以继续在闽、广沿海地区坚持抗元，当时的南宋孤臣陆秀夫、张世杰等人，带着两个娃娃皇帝端宗、幼主抵达泉州，赵呈率残部退至泉州城外法石寨，在这里的赵宋宗室子弟打算接应他们，但蒲寿庚拒不支援宋军，却“闭门不纳“、“闭门拒命“禁止宋军进入泉州，致使这一干人无奈继续南逃撤往广东。因此宋军改泊泉州外渚獭窟。张世杰只得护送端宗匆遽移粤，经漳州趋潮