新城要是不能守，四万守兵倒戈，你是打算开关放敌人进来，还是闭关投降敌人？”
“如果这样的话，敌人兵临城下，士兵像先前那样逃跑，哪里还用得上重关？”孙承宗说：“准备在山上建三座营寨，防止士兵溃逃。”
王在晋说：“士兵没有溃败就修筑营寨等待他们，你这是在教士兵逃跑吗？况且逃跑的士兵可以进来，敌人也可以尾随他们进来。你现在不为恢复做打算，却在这闭关自守，把关外防线全部撤离，还天天在朝廷争斗，京都以东还有安宁之日吗？”
孙承宗无话可说，孙承宗于是召集诸将商议关外防守的问题。
袁崇焕主张守宁远，阎鸣泰主张守觉华岛，王在晋主张守中前所。
孙承宗采用袁崇焕的建议，并亲自镇守关门。
而后明熹宗在孙承宗的建议下罢免了王在晋的辽东经略之职。
天启二年（1622年）八月，孙承宗于是自请为督师，还让蓟、辽等原来的将领监管各处，见机行事时不必受到其他人的限制。
孙承宗用阎鸣泰为辽东巡抚，又用鹿善继、王则古为赞画，并请求从国库带走八十万钱。
皇帝朱由校同意后，亲自将孙承宗送出宫门，并赐给孙