违禁者，不论官民，俱行正法，货物充公，违令者之财产奖给告发之人；
负责执行该禁令的文武各官失查或不追缉，从重治罪；保甲不告发的，即行处死；沿海可停泊舟船的地方，处处严防，不许片帆入海；
如有从海上登岸者，失职的防守官员以军法从事，督抚议罪。
迁海令的实行，使农业、渔业、手工业及海外贸易都遭受很大的摧残。
人民生计断绝，流离失所，其间曾不断发生激烈的反迁海斗争。迁海令的施行，不仅给社会经济带来严重恶果，而且，由于沿海空虚，海盗乘机活动，造成沿海社会治安更不得安宁。
在迁移过程中，满人和绿营兵也趁机威迫和勒索，强占百姓的土地，稍后有迟延，就抢夺烧杀。
同时，在天津港口设立了水寨，沿岸一带连营二十多里，以福船为城郭，小船居于内，可通往来，至晚上点上灯火，照的天心水面通红，从各军挑选的六千水兵日夜操练。
训练了一个多月，多尔衮在陈名夏的陪同下，来到天津巡视水师。
走近水寨中，多尔衮骑在马上远望军营，说道：“傍山依林，前后顾盼，出入有门，进退曲折，不错，这水寨设立的不错。”