了稳固住手中的实力，多年来最高当局一直没有停止对后两类中央军势力进行转化。尤其是第三类，更是最高当局在整编时的重中之重。
手段则还是老一套，掐头去尾，这套方法从军阀混战用到现在，最高当局已然是驾轻就熟。
“去尾法”针对的主要是普通士兵，对作战中损失较大的第三类中央军，往往军事委员会一纸命令就强行整编，趁着打败仗之后员额不足将这些部队从一个军编成一个师或几个团再编入黄埔系把持的基本部队。或者更直接地破坏建制打散后直接进行消化。从淞沪到武汉，这一路上最高当局没少消化地方部队，很多中央军因为甚至会在撤退时有意裹杂地方部队的溃兵，他们已经将杂牌军当成了补血的道具。
“掐头法”则需要耍些手段，顾名思义就是把部队的头脑去掉，由于过去的旧部队大多是私人部队，头脑一去，部队基本上群龙无首，只能听任摆布。掐头法也分文明和不文明两种，文明的是使用各种委任状将高级军官升个闲职调离；不文明的就是找个罪名、比如军纪败坏、贪污腐化、作战不力之类(这些罪名很大程度上还真不是捏造的)，把主官弄走，部队自然就被消化。
截止1938年10月底，最高当局指示军事委员会