明又亲自率大军，乘着大胜明军之势，出动大兵直取长沙。清军进迫，明军根本就不堪一击，纷纷如鸟兽散。章旷率军放弃湘阴逃往长沙，同督师何腾蛟商量对策。但何滕蛟这时也是策手无策，只能向驻守常德的堵胤锡救援。
堵胤锡收到了何滕蛴的求救之后，立刻派造马进忠、王允才部赶来救援长沙。但马、王二部还在途中时，清军就已经直趋长沙城下。何腾蛟、章旷眼看援兵未到, 也不敢于清军交战，只好乘船南撤，弃城而逃，结果清军兵不血刃, 就占领长沙。
随后清军又乘势两路进军，一路进攻常德府, 一路逅击何滕蛟。
因为这时长沙己失守，堵胤锡在常徳府也是孤掌难鸣，因此也守不住常徳，和忠贞营一起，败退到菱东地区，暂时驻守, 等待时机。而何滕蛟却是兵败如山，连续放弃衡州、宝庆、辰州等地，一直败退到永州。章旷在败退途中染病，死于永州，偏沅巡抚傅上瑞、部将董英、黄朝宣等人都向清军投降。
到这个时候,湖南之地仅仅只剩一个永州, 其他的地方基本都被清军占领了。
而耿仲明正要乘胜进军，夺取衡州，与尚可喜在湖南南部会师的时候，洪承畴的命令传来，令耿仲明把湖南交由韩岱管理，率