重要海岸据点，在平海卫附近与明军形成了拉锯战。而打劫福建福清的另一支倭寇，也打算与平海卫的倭寇联手。好在倭寇的图谋被刘显识破，刘显遂与福建总兵官俞大猷合兵于遮浪半岛，将盘踞在遮浪的倭寇全部消灭干净。平海卫的倭寇闻讯打算逃跑，却被把总许朝光拦截打败，并将倭寇船只全部烧光。
这时戚继光也率领所部前来增援，与刘显、俞大猷三部平倭主力大会师，一同合力作战，将兴化一带的倭寇全部歼灭，收复了失陷的兴化城。
由于刘显在这一场歼灭广东、福建一带倭寇的战役中功勋显著，朝廷论功行赏，在他原有正三品都指挥佥事的级别上晋升两级，为正二品的都督佥事。此时，江北的扬州、淮安、泰州、南通等地的倭寇尚未完全歼灭平定，朝廷决定设总兵官于狼山，统制大江南北，刘显改任总兵官驻军狼山。
到任后，总兵刘显为履行行部考核地方官员的职责，要求皇帝能下一道谕旨给他，以便好节制知府以下这些地方官员。由于通州同知王汝对刘显心生妒嫉——刘显部驻扎通州附近，而王汝为文官，不肯被刘显节制——于是上书弹劾刘显，指责刘显的请求是对皇帝的不恭，是非分要求……于是刘显被降职处分。
没多久嘉靖帝驾