兵造反，叛军一度声势浩大，四方云集，聚众数万，攻重镇，断漕运，所向披靡，一时震动天下。但随即在接下来的战斗之中节节失利，充分暴露了这帮人身为乌合之众的本色，常常有数万教众被数百官军冲垮的扑街场面出现。最终，徐鸿儒兵败身亡，王好贤南逃扬州被杀，闻香教因此遭受重创，内部也爆发了分裂，一度被迫偃旗息鼓。
在天启二年的徐鸿儒叛乱败亡之后，闻香教一直是大明朝廷重点打击的心腹大患，但是扎根于本土的闻香教生命力很顽强，尽管朝廷严厉镇压，但闻香教从来没有停止过活动，只不过行事低调了许多。
到了崇祯年间，天下兵灾祸乱愈发酷烈，朝廷已经无力再打压闻香教，于是闻香教这一造反专业户又再次死灰复燃。尤其是在崇祯三年、崇祯四年、崇祯五年，从山东到河南再到山西、陕西，整个中原连续三年大旱，是所谓：“既无收，麦又难种。野无青草，十室九空。于是有斗米值银五钱者，有工作一日不得升米者，有采草根树叶充饥者，有夫弃其妻、母弃其子者，有卖一子女不足数餐者，有自缢空林、甘填沟渠者，有饿死路侧者，有鹑衣菜色而行乞者，有枕比而毙者，有泥门担簦而逃者，有骨肉相残食者。”
崇祯五年夏，黄河大堤于孟津决