诏免她对皇太子李重俊、长宁公主等人行礼。中宗朝,韦后与安乐公主乱权,唯一惧怕太平公主多谋善断
太子李重俊谋反,安乐公主与宗楚客想趁机陷害太平公主与相王李旦兄妹,诬告他们与太子同谋,因为主审官御史中丞萧至忠对中宗流泪进谏:“陛下富有四海,却不能容一弟一妹,而使人罗织罪名陷害。”太平公主与李旦因而得以幸免于难,但太平公主与安乐公主的敌对已明显白热化。
唐中宗被韦后与安乐公主毒死,上官婉儿与太平公主一起草拟遗诏,立温王李重茂为皇太子,皇后知政事,相王李旦参谋政事,试图在韦后与皇族之间谋取平衡,但是宗楚客与韦后党羽商议,改立相王李旦为太子太师,架空了李旦,打破了这一个平衡。
太平公主派她的儿子薛崇简与刘幽求一起参与了李隆基等诛杀韦后的行动,清除了韦氏党羽,并亲手将李重茂拉下皇位,拥立相王李旦复位,是为唐睿宗。太平公主因为此番功劳而晋封万户,三子封王,为唐朝公主权势的顶峰。
太平公主在协助李隆基政变除掉韦后以后,与李隆基发生权争,她曾经要求睿宗废掉太子李隆基,并积极培植党羽。此时朝中七位宰相有五位是经由太平公主任命,文武百官除了姚崇,宋璟等寥寥数人