阿富汗、呼罗珊地区的联系，使敌人腹背受敌。因此哲别的兵团要秘密行军，而且路途艰险，他的困难之大，是难以想象的。
在出发前，成吉思汗于大帐中备酒为哲别饯行，深情地对他这位智勇兼备的大将说道：“这路兵马道路艰险，任务繁重，环顾众将，非你不能胜任，望好自为之。”
哲别回答得十分果断：“大汗派我火里去，我就去；大汗派我水里去，我也去！”
第三路军是成吉思汗和幼子拖雷率领的中军主力，先隐蔽于吹河南方，休兵养马，待正面部队吸引敌人之后，再秘密渡过锡尔河，穿越广阔难行的红沙漠，自西北方向奇袭不花剌城，以切断敌人新、旧两京城的联系，其间要在沙漠中艰苦行军半个多月。
为了防止玉龙杰赤的敌人从背后袭击，成吉思汗还做了一次离间工作，利用谟罕默德母子间的矛盾，派遣使者至玉龙杰赤对太后说：“我们蒙古军队无意进攻玉龙杰赤，等到各地平定以后，当以呼罗珊地区奉献给太后。”
太后虽然置之不答，但也没有从玉龙杰赤派兵从背后攻击成吉思汗，这说明离间计已经起到了作用。
在成吉思汗的大军越过阿尔泰山之后，便派遣使者前往谟罕默德处告知说：“今派兵马二十万，欲