通过抽签的形式，抽出四家来再凑一千人，总计两千人留在澎湖主岛上，作为最后一批撤离的人员。同时郑芝龙也特地派了数艘快船前往漳泉附近海域，监视联军的动向。
而海峡对面的联军自然也没有闲着，加紧了在海峡内的巡航力度，双方在四月中旬的短短数天之中，就在海上交手了好几次。不过十八芝一方明显吃亏多一些，因为联军派出来巡航的船只几乎都装备了产自海汉的火炮，而十八芝的侦察船为求轻快，船上基本不会配备任何重武器，双方一旦接近到一定的距离，联军一方的火炮就会让十八芝的海船尝到只能挨打不能还手的滋味。
到四月下旬，十八芝的船已经不敢在白天靠近金门岛附近海域进行抵近侦察，只能选择入夜之后才从比较远的地方驶到近处进行观察。这样的侦察效果自然好不到哪里去，只能大致地判断出联军一方的舰队规模。郑芝龙所获得的报告，也只是三百到五百艘船这样一个比较模糊的数字。
尽管十八芝手头可用的船远远不止三五百艘，但郑芝龙也明白自家的船跟对手的船比起来并不在一个实力层面上，南日岛的教训已经充分表明了双方的实力差距，郑芝龙也并不打算再用自家的海船和儿郎白白去给对手刷战绩了。
四月